Metodi Matematici e Fisici Applicati alle Biotecnologie
Corso
di Laurea Magistrale in Biotecnologie per l’ Industria e per l’Ambiente
Corso
di Laurea Magistrale in Genomica Funzionale e Bioinformatica
A.A. 2007-2008
Prof. Giovanni
Naldi
Dott.ssa.
Paola Donati
Programma
Diario
delle lezioni
Materiale
Didattico
Prossimi Appelli d'esame:
, Nuovo
orario e sede:
ore: 13.30, Aula 7 (piano terra, Dipartimento
di Matematica, via Saldini 50)
10.30, Aula C (II piano, Dipartimento
di Matematica, via Saldini 50)
| 1 Ottobre 2007 | Introduzione al corso, Introduzione alle equazioni differenziali ordinarie (esempio di dinamica di popolazioni con solo nascite e nascita/morte) | due link recenti (tra i tanti) per le relazioni Matematica - Biologia:
Abstractions (da Nature 437, 29 settembre 2005) Mathematics in Biology (speciale di Science, 6 February 2004 Volume 303 Number 5659) Lecture Notes of Prof. E. Sontag on Mathematical Biology |
| 2 Ottobre 2007 | Equazioni lineari, equazione logistica, studio qualitativo
equazione logistica, stabilità |
Breve introduzione (di sopravvivenza matematica) alle equazioni differenziali ---> diffeq.pdf |
| 8 Ottobre 2007 | Equazione logistica e punti di equilibrio, Caso studio: detecting art forgeries | Breve nota (Iowa State University) ---> vermeer.pdf
Wikipedia --> lead |
| 9 Ottobre 2007 | Caso studio: detecting art forgeries; introduzione modelli preda/predatore (modelli Lotka-Volterra) | Modello di Lotka-Volterra --->
UNICT (Corso Prof. M. Anile)
Modello dpreda/predatore ---> POLIMI (Corso Prof. M. Gatto, Prof. R. Casagrandi) |
| 15 Ottobre 2007 | Sistemi di equazioni differenziali, spazio delle fasi, stabilità | |
| 16 Ottobre 2007 | Costruzione di un modello (dinamica delle chioccioline) | Articolo: "Left Snails and Right Minds", Natural History, April 1995, pp. 10-18, S.J. Gould |
| 22 Ottobre 2007 | Modelli discreti, equazione logistica discreta, stabilita' e caoticita' (Dott. M. Semplice) | articolo di R. M. May (Nature, vol 261, 10 June 1976) |
| 23 Ottobre 2007 | Funzioni in piu' variabili (introduzione, curve di livello, ... ) | nuovo link per materiale didattico, Universita' di Torino, Quaderni
Didattici, Corso
di Matematica B (S. Benenti, C. Chanu, A. Fino)
Due lucidi del Collega G. Guerra (UniMIB): - funzione due variabili - curve di livello |
| 29 Ottobre 2007 | Derivate parziali, esempi, gradiente, piano tangente | Alcuni lucidi di G. Guerra (UniMIb):
- derivata lungo una direzione (1) - derivata lungo una direzione (2) - Proprieta' geometriche del gradiente - Piano tangente 1 - Piano tangente 2 |
| 30 Ottobre 2007 | Traiettorie modello Preda-predatore,
modello SIR (epidemiologia) |
Due esercizi su epidemie del Prof. D.P. O'Leary
(Computing in Science and Engineering) Epidemia1 Epidemia2 |
| 5 Novembre 2007 | Metodo dei minimi quadrati, esempio (retta minimi quadrati, calcolo e significato), identificazione dei parametri | (Elenco di alcuni progetti per l'esame finale: vedi sotto) |
| 6 Novembre 2007 | Nobel
Lecture (1963) di Alan L. Hodgkin
Nobel Lecture (1963) di Andrew F. Huxley Nobel Lecture (1963) di Sir John Eccles Commentary Nature-Medicine 5 (1999) Articolo di Bertil Hille (Ionic Channels in Nerve Membranes) |
Alcuni Argomenti per il progetto per l'Esame (NOTA: i file pdf sono da intendersi per uso esclusivamente all'interno dell'esame del corso):
- Traduzione di un testo storico: The Struggle for Existence (Georgyi Frantsevitch Gause, 1934), vedere capitoli I, II, III, IV, i primi due come introduzione per l'esame riportare il III e il IV Capitolo.
- Articolo su Chemostato, Nonlinear population dynamics in the chemostat, Grivet, J.-P.; Computing in Science & Engineering Volume 3, Issue 1, Jan.-Feb. 2001 Page(s):48 - 55
- Balene --> whales.pdf
- Popolazione cellulare ---> cell.pdf
- Prato ---> grassland.pdf
- Biocinetica --> biokinetics.pdf
- Preda/Predatore con effetto temperatura --> predator_prey.pdf
- Modello dei salmoni di Ricker ---> Ricker_model.pdf
- Castori ---> small_mammal_disperion.pdf
